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山東省農業科學院植保所在解析微小型卵寄生蜂染色體水平基因組方面取得新進展

   日期:2025-03-31     來源:山東省農業科學院    瀏覽:16    
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                         山東省農業科學院植保所在解析微小型卵寄生蜂染色體水平基因組方面取得新進展
放大字體  縮小字體時間:2025-03-31 09:10 來源:山東省農業科學院 
    近日,植保所天敵與授粉昆蟲利用創新團隊在Nature旗下期刊Scientific Data(Q1,5-year IF = 8.9)發表題為“A chromosomal-level genome assembly of Trichogramma chilonis Ishii, 1941 (Hymenoptera: Trichogrammatidae)”的研究論文,解析了螟黃赤眼蜂(Trichogramma chilonis)的單倍型全基因組序列,是首個公開發布的赤眼蜂染色體水平的高質量參考基因組。
 
  赤眼蜂(Trichogramma spp.)是一種微小型卵寄生蜂,以各種鱗翅目害蟲的卵為食,常用于農業害蟲管理。目前,這類微小型寄生蜂的高質量基因組資源十分匱乏,阻礙了我們對該群體的種群進化和寄生生態學的理解。本研究通過整合PacBio HiFi、Illumina和Hi-C數據,獲得了螟黃赤眼蜂(T. chilonis)的染色體水平基因組。基因組大小為202.48 Mb,N50長度為40.00 Mb。共有98.59% (199.63 Mb)的contigs被有效地映射到5條染色體上。BUSCO測序結果顯示,該基因組組裝完整性為98.1% (n = 1367),其中95%為單拷貝BUSCOs, 3.1%為重復BUSCOs。此外,基因組包含24.16% (48.91 Mb)重復序列和12,163個預測的蛋白質編碼基因。本研究中所展示的高質量的螟黃赤眼蜂基因組為闡明其進化路徑和寄生生態潛在的分子機制提供了寶貴的資源。
 
  山東省農業科學院植物保護研究所為該文章的第一完成單位,植保所博士后王成興為文章第一作者,翟一凡研究員為文章通訊作者。該研究得到國家重點研發計劃和山東省泰山學者青年專家項目的支持。(撰稿:王成興; 核稿:周起先)
 
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